哺乳類（9種）
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ジネズミ、キクガシラコウモリ、モモジロコウモリ、ムササビ、ツキノワグマ、アナグマ 等 |
| 鳥類（85種） |
カンムリカイツブリ、チュウサギ、マガモ、トモエガモ、ミサゴ、ハチクマ、オジロワシ、オオタカ、サシバ、クマタカ、ハヤブサ、ヤマドリ、クイナ、コチドリ、タゲリ、トウネン、ヤマシギ、カッコウ、アオバズク、ヨタカ、ヤマセミ、ブッポウソウ、アオゲラ、ヤイロチョウ、ビンズイ、サンショウクイ、ヒレンジャク、カワガラス、ミソサザイ、コマドリ、サンコウチョウ、コガラ、ミヤマホオジロ、コムクドリ 等 |
| 爬虫類（6種） |
イシガメ、スッポン、ヤモリ、ジムグリ、シロマダラ、ヒバカリ |
| 両生類（13種） |
アベサンショウウオ、オオサンショウウオ、イモリ、ニホンヒキガエル、タゴガエル、シュレーゲルアオガエル、モリアオガエル 等 |
| 魚類（24種） |
カワヤツメ、アブラハヤ、タカハヤ、ヤリタナゴ、ナガレホトケドジョウ、アカザ、メダカ、イトヨ、トウヨシノボリ 等 |
| 昆虫類（38種） |
モートンイトトンボ、ムカシトンボ、ムカシヤンマ、ミヤマサナエ、カバフキシタバ、キイロサナエ、サラサヤンマ、ハネビロエゾトンボ、ハッチョウトンボ、ヒナカマキリ、ヒゲシロスズ、スズムシ、ゲンゴロウ、ヤマトモンシデムシ、ヨコミゾドロムシ、ヒメボタル、ハラグロオオテントウ、クワカミキリ、オオホシオナガバチ、ギフチョウ、ムラサキツバメ、オオムラサキ 等 |
| クモ類（1種） |
ワスレナグモ |
| 底生動物（11種） |
イシマキガイ、マルタニシ、モノアラガイ、ミナミヌマエビ、キイロサナエ 等 |
| 注目すべき生息地 |
アオサギの集団繁殖地、イワツバメの集団繁殖地 |
